Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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