Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms