Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 CADM3-202ENST00000368125 3745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 PDE2A-201ENST00000334456 4315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
A4D1N5 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
A4D1N5 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
A4D1N5 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
A4D1N5 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
A4D1N5 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
A4D1N5 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
A4D1N5 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
A4D1N5 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
A4D1N5 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
A4D1N5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
A4D1N5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
A4D1N5 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
A4D1N5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
A4D1N5 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
A4D1N5 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
A4D1N5 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
A4D1N5 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
A4D1N5 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
A4D1N5 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
A4D1N5 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
A4D1N5 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
A4D1N5 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
A4D1N5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
A4D1N5 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
A4D1N5 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
A4D1N5 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms