Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF8Q9UPP1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms