Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms