Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms