Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB9

PGLYRP3, Peptidoglycan recognition protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP3Q96LB9 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGLYRP3Q96LB9 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGLYRP3Q96LB9 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGLYRP3Q96LB9 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGLYRP3Q96LB9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGLYRP3Q96LB9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGLYRP3Q96LB9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGLYRP3Q96LB9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PGLYRP3Q96LB9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PGLYRP3Q96LB9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGLYRP3Q96LB9 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGLYRP3Q96LB9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGLYRP3Q96LB9 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGLYRP3Q96LB9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PGLYRP3Q96LB9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PGLYRP3Q96LB9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGLYRP3Q96LB9 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGLYRP3Q96LB9 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGLYRP3Q96LB9 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGLYRP3Q96LB9 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGLYRP3Q96LB9 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGLYRP3Q96LB9 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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PGLYRP3Q96LB9 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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PGLYRP3Q96LB9 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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PGLYRP3Q96LB9 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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