Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms