Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms