Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms