Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.07■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.07■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
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USP34Q70CQ2 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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USP34Q70CQ2 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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USP34Q70CQ2 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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USP34Q70CQ2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.05■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.05■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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