Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms