Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP2B3Q16720 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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