Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
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