Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms