Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms