Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARHGEF6Q15052 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARHGEF6Q15052 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARHGEF6Q15052 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARHGEF6Q15052 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARHGEF6Q15052 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARHGEF6Q15052 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARHGEF6Q15052 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARHGEF6Q15052 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARHGEF6Q15052 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARHGEF6Q15052 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
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