Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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