Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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STRN3Q13033 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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