Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms