Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms