Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN1Q04323 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms