Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms