Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms