Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TGFBR1P36897 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms