Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PLNP26678 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms