Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFE3P19532 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TFE3P19532 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFE3P19532 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFE3P19532 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFE3P19532 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFE3P19532 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFE3P19532 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFE3P19532 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFE3P19532 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFE3P19532 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFE3P19532 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFE3P19532 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFE3P19532 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFE3P19532 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFE3P19532 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFE3P19532 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFE3P19532 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFE3P19532 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TFE3P19532 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TFE3P19532 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms