Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEFHP12036 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NEFHP12036 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NEFHP12036 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NEFHP12036 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NEFHP12036 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NEFHP12036 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NEFHP12036 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NEFHP12036 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NEFHP12036 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NEFHP12036 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEFHP12036 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEFHP12036 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEFHP12036 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEFHP12036 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEFHP12036 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEFHP12036 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEFHP12036 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEFHP12036 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEFHP12036 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEFHP12036 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEFHP12036 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEFHP12036 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEFHP12036 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEFHP12036 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEFHP12036 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEFHP12036 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEFHP12036 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms