Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRFP10586 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms