Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCATO75600 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCATO75600 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCATO75600 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCATO75600 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCATO75600 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GCATO75600 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCATO75600 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCATO75600 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCATO75600 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCATO75600 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCATO75600 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCATO75600 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCATO75600 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCATO75600 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCATO75600 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GCATO75600 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GCATO75600 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCATO75600 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCATO75600 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCATO75600 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCATO75600 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCATO75600 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCATO75600 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCATO75600 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCATO75600 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCATO75600 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCATO75600 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCATO75600 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCATO75600 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCATO75600 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCATO75600 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCATO75600 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCATO75600 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCATO75600 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms