Protein–RNA interactions for Protein: O15013

ARHGEF10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10O15013 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF10O15013 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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