Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
E9PBE3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
E9PBE3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E9PBE3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E9PBE3 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E9PBE3 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
E9PBE3 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E9PBE3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E9PBE3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E9PBE3 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E9PBE3 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms