Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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C4orf47A7E2U8 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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C4orf47A7E2U8 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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C4orf47A7E2U8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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C4orf47A7E2U8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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C4orf47A7E2U8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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C4orf47A7E2U8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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C4orf47A7E2U8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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C4orf47A7E2U8 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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C4orf47A7E2U8 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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C4orf47A7E2U8 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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