Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms