Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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PCDH10Q9P2E7 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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PCDH10Q9P2E7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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PCDH10Q9P2E7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCDH10Q9P2E7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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