Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM3Q9BZL3 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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