Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms