Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD5Q99717 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms