Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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RPS6KC1Q96S38 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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RPS6KC1Q96S38 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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RPS6KC1Q96S38 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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RPS6KC1Q96S38 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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