Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTV1Q96GA3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTV1Q96GA3 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms