Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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SGF29Q96ES7 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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