Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP3Q8WYN3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms