Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZIC4Q8N9L1 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms