Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms