Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms