Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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CDO1Q16878 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms