Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RTN1Q16799 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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RTN1Q16799 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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RTN1Q16799 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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RTN1Q16799 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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RTN1Q16799 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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RTN1Q16799 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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RTN1Q16799 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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RTN1Q16799 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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RTN1Q16799 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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