Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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