Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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RAB35Q15286 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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RAB35Q15286 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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RAB35Q15286 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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RAB35Q15286 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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