Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms